Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ZNF548Q8NEK5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF548Q8NEK5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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