Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TXNDC2Q86VQ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TXNDC2Q86VQ3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms