Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CATSPER4Q7RTX7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms