Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KNDC1Q76NI1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KNDC1Q76NI1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms