Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms