Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TMUB2Q71RG4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TMUB2Q71RG4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms