Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRIG3Q6UXM1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms