Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZBED9Q6R2W3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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