Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FBXO42Q6P3S6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms