Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKDCCQ504Y2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms