Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GREB1Q4ZG55 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms