Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYTL3Q4VX76 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms