Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTXN3Q4LDR2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms