Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC14Q49A88 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms