Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KNOP1Q1ED39 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KNOP1Q1ED39 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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