Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RTL8BQ17RB0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RTL8BQ17RB0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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RTL8BQ17RB0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RTL8BQ17RB0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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