Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms