Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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RTN1Q16799 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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RTN1Q16799 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTN1Q16799 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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