Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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