Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK5Q16478 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK5Q16478 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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