Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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