Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NEDD8Q15843 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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NEDD8Q15843 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NEDD8Q15843 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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