Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA6Q15825 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms