Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TCEA2Q15560 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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