Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PDCD1Q15116 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms