Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRD3Q15059 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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