Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CHD4Q14839 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHD4Q14839 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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