Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SMCO1Q147U7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SMCO1Q147U7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SMCO1Q147U7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SMCO1Q147U7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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