Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNB1Q14721 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms