Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GBX1Q14549 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GBX1Q14549 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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