Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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