Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMC2Q13753 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMC2Q13753 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms