Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CACNA1SQ13698 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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