Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TSTA3Q13630 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms