Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CUL1Q13616 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms