Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3B2Q13367 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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