Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms