Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDRQ13258 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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