Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms