Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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