Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GRIK3Q13003 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GRIK3Q13003 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GRIK3Q13003 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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