Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms