Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PTPN13Q12923 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PTPN13Q12923 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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