Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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