Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOBRQ0VD83 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms