Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SYCNQ0VAF6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms