Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CYP4F3Q08477 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms