Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms