Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNB3Q05901 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms