Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNEQ04844 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNEQ04844 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms